50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1925 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1925    100 
 
 		 596 bp  1181    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  82.39 
 
 		 1212 bp  83.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    89.71 
 
 		 3399 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  86.9 
 
 		 1200 bp  79.8  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  86.9 
 
 		 1200 bp  79.8  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  89.71 
 
 		 1209 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  88.73 
 
 		 1209 bp  77.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  82.09 
 
 		 1014 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  84.38 
 
 		 1209 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  87.32 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  80.85 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  80.85 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  97.3 
 
 		 558 bp  65.9  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3235    89.47 
 
 		 261 bp  65.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  86.96 
 
 		 1155 bp  65.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  89.29 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  89.29 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0949  hypothetical protein  94.87 
 
 		 111 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00960293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  88.14 
 
 		 408 bp  61.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    97.14 
 
 		 1184 bp  61.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3905    96.97 
 
 		 159 bp  58  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  92.5 
 
 		 927 bp  56  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  85.29 
 
 		 444 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  92.5 
 
 		 927 bp  56  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  94.29 
 
 		 801 bp  54  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    85.71 
 
 		 2705 bp  54  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  94.12 
 
 		 1200 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  81.19 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    86.79 
 
 		 457 bp  50.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  81.19 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  81.19 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    100 
 
 		 228 bp  48.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    93.75 
 
 		 319 bp  48.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>