More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1749 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1749  carbonic anhydrase  100 
 
 
356 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0741  carbonic anhydrase  79.53 
 
 
343 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  58.38 
 
 
340 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  57.06 
 
 
368 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1506  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  56.59 
 
 
340 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2259  carbonic anhydrase  58.16 
 
 
339 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.288291  normal  0.676633 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0545  carbonic anhydrase  50.92 
 
 
340 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  hitchhiker  0.00175013 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3659  carbonic anhydrase  46.11 
 
 
347 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0725502  normal  0.181373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5022  carbonic anhydrase  49.4 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.585067  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  41.25 
 
 
177 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  39.76 
 
 
185 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  37.66 
 
 
174 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35304  predicted protein  35.95 
 
 
175 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  34.57 
 
 
180 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  42.11 
 
 
179 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
181 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  30.12 
 
 
184 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  30.14 
 
 
172 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.88 
 
 
169 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  40 
 
 
179 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1211  hexapeptide transferase family protein  34.87 
 
 
192 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.534657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  38.81 
 
 
177 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  33.76 
 
 
178 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  36.14 
 
 
180 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  36.17 
 
 
181 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  29.3 
 
 
171 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  36.36 
 
 
182 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  35.46 
 
 
181 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  34.62 
 
 
180 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  34.62 
 
 
180 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
185 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  35.66 
 
 
182 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  35.66 
 
 
182 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  37.42 
 
 
176 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.1 
 
 
174 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  35.66 
 
 
182 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
189 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  27.15 
 
 
169 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
180 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  36.24 
 
 
178 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  35.37 
 
 
180 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  30.07 
 
 
172 aa  85.9  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  32.48 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  35.37 
 
 
180 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  40.51 
 
 
188 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  36.3 
 
 
179 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  37.04 
 
 
181 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  35.76 
 
 
179 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.81 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  32.48 
 
 
183 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  29.87 
 
 
170 aa  84  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  29.03 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  34.19 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  28.3 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  27.45 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  32.93 
 
 
176 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  29.94 
 
 
170 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  29.3 
 
 
170 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  29.3 
 
 
170 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  29.3 
 
 
170 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  29.3 
 
 
170 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  29.3 
 
 
170 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  30.86 
 
 
184 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  29.8 
 
 
174 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  34.5 
 
 
180 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  31.85 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  32.48 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.92 
 
 
175 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  31.65 
 
 
179 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  33.12 
 
 
184 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  34.12 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  30.49 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  30.67 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  29.3 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  29.14 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  36.54 
 
 
174 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  36.64 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  30.38 
 
 
180 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  29.3 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  29.3 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  34.42 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  32.42 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  29.3 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  31.21 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  30.57 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  31.21 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.25 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  36.09 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  33.77 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  35.06 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  32.3 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  34.67 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  33.77 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  29.94 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>