72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0875 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0875  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1610  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.88 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2942  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00934275  hitchhiker  0.000711707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  32.84 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  32.84 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.54 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.84 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.87 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  33.85 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.37 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1385  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.85 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  35.14 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  34.33 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.56 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.86 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.56 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.86 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.58 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0272  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.34 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  28.57 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.14 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.89 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.75 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.16 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.12 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1125  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.75 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  31.43 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.91 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0634  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.79 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  25 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.88 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  31.34 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.17 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.56 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5479  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.87 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  28.36 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.16 
 
 		 106 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.99 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.46 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.98 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  30.16 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.16 
 
 		 108 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>