More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4316 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4316  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.866309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3968  inositol-phosphate phosphatase  46.61 
 
 		 286 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6070  inositol monophosphatase  45.24 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.712503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  43.25 
 
 		 487 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1604  inositol-phosphate phosphatase  41.36 
 
 		 290 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  36.84 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0651  putative inositol monophosphatase protein  41.41 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102774  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2304  inositol-phosphate phosphatase  41.02 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  37.71 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  40.67 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  41.71 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  39.02 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  36.86 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  36.86 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  39.55 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  40.57 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3411  Inositol-phosphate phosphatase  37.8 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  36.86 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  35.59 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  36.44 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  36.76 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  38.15 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  36.76 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  40.52 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  43.94 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  38.36 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  41.23 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  41.79 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  40.79 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  41.79 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  34.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  40.09 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  34.51 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  35.89 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  39.73 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  37.95 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.16 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.73 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  35.87 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1758  Inositol-phosphate phosphatase  35.69 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0897515  normal  0.0157082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  37.28 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.87 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  41.2 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  37.71 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  37.02 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  38.22 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  39.81 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  37.01 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  36.77 
 
 		 363 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  35.15 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  35.86 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  34.5 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  34.5 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  34.5 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  34.51 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  38.81 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  37.22 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3842  inositol-phosphate phosphatase  33.99 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4828  inositol monophosphatase  38.1 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.244945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  36.49 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  36.99 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  34.71 
 
 		 267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.22 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  35.74 
 
 		 267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  34.71 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  34.71 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  36.17 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  34.71 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  37.93 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  37 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  34.71 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  35.63 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.2 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  35.68 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.9 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.8 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  36.65 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  40 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0983  inositol monophosphatase  38.22 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133675  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  37.93 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  37.44 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>