17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2424 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  52.22 
 
 		 203 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  44.08 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  42.57 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  41.38 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  41.38 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  40.8 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  40.39 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  36.92 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  35.84 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  27.37 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  39.42 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  36 
 
 		 108 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  27.87 
 
 		 388 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  34.25 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>