19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0746 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  338  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0950  hypothetical protein  41.04 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  25.99 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  30.77 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  24.84 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  24.84 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  26.45 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1909  hypothetical protein  29.37 
 
 		 326 aa  40.8  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.294784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  29.01 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>