71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0333 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0333  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  33 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  30.3 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  42.62 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  34.07 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  26.97 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  35.62 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  35.62 
 
 
133 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  28.87 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  34.83 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  34.25 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0848  hypothetical protein  32.94 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.225476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  25.23 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  34.25 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  27.64 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  34.25 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  25.23 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  34.25 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  29.03 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  32.88 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  28.89 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  29.07 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  42.59 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  31.43 
 
 
122 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  35.8 
 
 
135 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  29.33 
 
 
138 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  29.07 
 
 
117 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  32.88 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  38.33 
 
 
131 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  27.03 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  23.96 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  30.86 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  28.28 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  30.86 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  43.18 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  34.55 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  30.49 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  28.72 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  26.37 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  34.48 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  27.17 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1723  hypothetical protein  32.69 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.822691  normal  0.436905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  26.04 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  23.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  23.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  23.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  23.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  27.59 
 
 
123 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  35.19 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  29.07 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  32.73 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  33.33 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0218  hypothetical protein  30.99 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0217  hypothetical protein  30.99 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0964  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05350  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4506  hypothetical protein  35.19 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  25.19 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>