17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2338 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  228  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  37.66 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  31.91 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  33.68 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  32.98 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  34.67 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  38.16 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  37.84 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  36 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  31.68 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  34.83 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  29.47 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  30.85 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  42.03 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  35.21 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>