31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1911 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  692    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  38.02 
 
 
384 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  35.48 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  36.46 
 
 
383 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  36.46 
 
 
383 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  37.4 
 
 
383 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  37.4 
 
 
383 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.52 
 
 
669 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  37.4 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  37.4 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  37.4 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  36.73 
 
 
361 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  35.84 
 
 
383 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  36.1 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  36.6 
 
 
409 aa  179  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  31.31 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  31.71 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  27.62 
 
 
210 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  30.81 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  27.07 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  29.05 
 
 
210 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27280  glycopeptide antibiotics resistance protein  25.13 
 
 
231 aa  63.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  28.65 
 
 
210 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  30.99 
 
 
172 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  28.05 
 
 
194 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  27.95 
 
 
195 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  31.48 
 
 
185 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  28.93 
 
 
198 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  31.45 
 
 
211 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  36.84 
 
 
216 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0215  VanZ family protein  27.04 
 
 
203 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>