39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21340  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0704715  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 83 bp  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 84 bp  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  91.86 
 
 		 86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 86 bp  97.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0010  tRNA-Tyr  91.46 
 
 		 84 bp  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0012  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  90 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0065  tRNA-Tyr  95.83 
 
 		 82 bp  79.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0649781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  88.61 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  86.75 
 
 		 83 bp  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0074  tRNA-Tyr  91.3 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  87.95 
 
 		 81 bp  69.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0008  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0008  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  84.71 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  86.76 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0050  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0012  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.790999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  86.96 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  84.85 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>