54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0012 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0012  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.790999  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0014  tRNA-Tyr  100 
 
 		 75 bp  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  91.46 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  90.28 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  90.28 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  87.8 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0010  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0074  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  87.8 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0008  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000321728  hitchhiker  0.00000918644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0014  tRNA-Tyr  89.86 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526877  normal  0.0596738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0012  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000365391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  87.67 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0065  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0649781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0012  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0011  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07640  tRNA-Tyr  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  0.0415819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0062  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  85.29 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21440  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000199792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA69  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00000487503  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0013  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R89  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t05  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0069  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0014  tRNA-Tyr  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.673141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0051  tRNA-Tyr  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0013  tRNA-Tyr  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000444451  normal  0.406861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  84 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21340  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0704715  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  84 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>