42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  60.54 
 
 
167 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  54.07 
 
 
175 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  54.07 
 
 
175 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  54.07 
 
 
175 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  42.46 
 
 
340 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  50.64 
 
 
175 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  52.59 
 
 
175 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  51.85 
 
 
186 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  45.05 
 
 
321 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  48.91 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  42.08 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  48.53 
 
 
300 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  51.77 
 
 
205 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  41.43 
 
 
295 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  48.18 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  39.38 
 
 
238 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  47.79 
 
 
172 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  46.5 
 
 
170 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  43.06 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  44.44 
 
 
173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  44.06 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  48.53 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  41.72 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  45.26 
 
 
169 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  53.28 
 
 
157 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  43.7 
 
 
162 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  44.93 
 
 
169 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  42.45 
 
 
216 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  49.28 
 
 
163 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  39.1 
 
 
194 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  40.44 
 
 
160 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  36.5 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  43.75 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  43.57 
 
 
154 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  41.29 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  41.96 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  32.31 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  26.92 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  26.92 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>