38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  259  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  38.04 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  38.54 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  38.38 
 
 
105 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  35.54 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  32.41 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  38.78 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  36.79 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  36.11 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  30.91 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  28.18 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  28.18 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  28.18 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  31.63 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  36.79 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  31.91 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  32.65 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  23.97 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  31.71 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.29 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  31.91 
 
 
102 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  31.52 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  29.81 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  21.38 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  24.21 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  32.91 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  25.6 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  27 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  34.29 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  29.73 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  31.68 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  25.53 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>