More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4126 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  100 
 
 		 334 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  65.43 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  64.55 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  64.55 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  64.55 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  65.26 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  63.27 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  61.99 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  59.82 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  55.03 
 
 		 322 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  53.92 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  62.45 
 
 		 260 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  54.21 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  51.71 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  49.23 
 
 		 503 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  45.91 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  47.2 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.41 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41.64 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  44.97 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  38.17 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  37.99 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.25 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  38.15 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  38.08 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.39 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  36.34 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  37.89 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.57 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  37.19 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.8 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  35.82 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  34.57 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  36.11 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  34.95 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  35.65 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  36.64 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.14 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.85 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.48 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  35.15 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.3 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  36.11 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  36.11 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  36.11 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  34.53 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.84 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  34.03 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  44.63 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  30.68 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  33.12 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.94 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  30.9 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  33.02 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  30.9 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  32.49 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  33.23 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  31.76 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  32.07 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  32.07 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  32.07 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.86 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  34 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  33.86 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  28.87 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  33.44 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  33.12 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  32.4 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.55 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.49 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  33.33 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  30.72 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.03 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  52.58 
 
 		 287 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.56 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  35.26 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  35.26 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  35.26 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  34.88 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  34.68 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.87 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  34.36 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  34.66 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>