203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4106 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  100 
 
 
280 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  59.62 
 
 
297 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  55.27 
 
 
280 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  55.47 
 
 
277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  55.89 
 
 
277 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  55.09 
 
 
274 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  52.99 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  53.16 
 
 
267 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  55.34 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  54.61 
 
 
274 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  52.06 
 
 
281 aa  235  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  48.47 
 
 
277 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  48.54 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  52.55 
 
 
283 aa  232  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  50.99 
 
 
267 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  47.55 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  49.45 
 
 
273 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  46.51 
 
 
279 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  47.35 
 
 
285 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  47.35 
 
 
285 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  48 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  43.88 
 
 
281 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  44.89 
 
 
281 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3647  siderophore-interacting protein  45.86 
 
 
273 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  44.78 
 
 
282 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  42.7 
 
 
258 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  47.41 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  43.14 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  43.22 
 
 
283 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  43.87 
 
 
247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.81 
 
 
267 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  38.89 
 
 
285 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02400  siderophore-interacting protein  40.69 
 
 
292 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  40.24 
 
 
270 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  33.2 
 
 
257 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  37.6 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  35.42 
 
 
251 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  35.42 
 
 
250 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.57 
 
 
277 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  39.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.57 
 
 
247 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  34.98 
 
 
252 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  38.08 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.73 
 
 
248 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.66 
 
 
281 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  33.46 
 
 
272 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  34.42 
 
 
271 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  32.28 
 
 
247 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  39.36 
 
 
311 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  31.47 
 
 
246 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  34.16 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  34.96 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  38.46 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.26 
 
 
271 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.98 
 
 
266 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  32.3 
 
 
257 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  38.46 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  38.37 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.77 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  38.76 
 
 
265 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.09 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.2 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  36.8 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.14 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  38.81 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  36.8 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  36.51 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  34.42 
 
 
277 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  37.65 
 
 
273 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  35.32 
 
 
275 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  37.2 
 
 
259 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  32.84 
 
 
295 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  35.25 
 
 
265 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  35.46 
 
 
255 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.45 
 
 
272 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  36.19 
 
 
304 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  36.18 
 
 
273 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.63 
 
 
289 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  36.18 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.77 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.18 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.11 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.18 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.78 
 
 
210 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  36.25 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.66 
 
 
256 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.63 
 
 
253 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.1 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  39.2 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  34.73 
 
 
253 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.77 
 
 
273 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.1 
 
 
299 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>