More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4040 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4040  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
368 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  69.23 
 
 
369 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34080  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.87 
 
 
367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3736  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.59 
 
 
381 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3475  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.94 
 
 
385 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2907  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.96 
 
 
373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.978058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0297  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.57 
 
 
361 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3515  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.48 
 
 
370 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.315655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2351  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.46 
 
 
369 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.304441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18610  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.32 
 
 
385 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08970  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.47 
 
 
382 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3344  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.85 
 
 
341 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.675292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4315  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.66 
 
 
362 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06060  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.3 
 
 
375 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8993  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.03 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.09 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0299  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.99 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2071  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.28 
 
 
350 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0164  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.69 
 
 
381 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0781323  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
357 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4388  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.23 
 
 
354 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1636  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.03 
 
 
366 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7209  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.91 
 
 
386 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0442513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0155  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.85 
 
 
384 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6141  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.01 
 
 
359 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5048  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.51 
 
 
360 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.56 
 
 
369 aa  356  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10824  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.04 
 
 
364 aa  348  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4625  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
357 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4538  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
357 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4921  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
357 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5111  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.75 
 
 
384 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182331  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37870  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.39 
 
 
356 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3575  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.63 
 
 
358 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0501989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0949  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.23 
 
 
369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4757  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.82 
 
 
351 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.73 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.4 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.81 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.94 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.88 
 
 
340 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.49 
 
 
347 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
350 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.29 
 
 
351 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.41 
 
 
349 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.77 
 
 
340 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.67 
 
 
350 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.73 
 
 
339 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.47 
 
 
336 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.58 
 
 
341 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.38 
 
 
352 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.43 
 
 
352 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.13 
 
 
352 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.35 
 
 
346 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.56 
 
 
352 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
346 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.18 
 
 
348 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.33 
 
 
348 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.74 
 
 
349 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.53 
 
 
350 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.89 
 
 
362 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.97 
 
 
352 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.97 
 
 
352 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.97 
 
 
352 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04210  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.48 
 
 
411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.974384  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0034  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.04 
 
 
362 aa  289  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.79 
 
 
344 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.48 
 
 
346 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.16 
 
 
345 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.34 
 
 
346 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.87 
 
 
345 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.54 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.15 
 
 
349 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.41 
 
 
345 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.41 
 
 
353 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.07 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
353 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.61 
 
 
348 aa  285  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.77 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.1 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.98 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.29 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.57 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.28 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.54 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.27 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.58 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.82 
 
 
333 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.65 
 
 
342 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
410 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.22 
 
 
363 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.94 
 
 
347 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.57 
 
 
359 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.48 
 
 
346 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.94 
 
 
347 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.76 
 
 
340 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.94 
 
 
347 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.04 
 
 
346 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.58 
 
 
345 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>