93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3833 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3833  protein of unknown function UPF0157  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4958  hypothetical protein  55.38 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0375692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12970  hypothetical protein  53.89 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  39.46 
 
 		 404 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  40.91 
 
 		 430 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  38.58 
 
 		 394 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  37.95 
 
 		 402 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  36.9 
 
 		 395 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  37.37 
 
 		 385 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  37.37 
 
 		 385 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4039  protein of unknown function UPF0157  37.31 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.75 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  34.65 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.25 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  38.04 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  38.15 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  39.74 
 
 		 404 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  31.22 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  32.6 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.5 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  26.53 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  32.22 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.64 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  36.51 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.68 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  35.33 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  27.37 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  27.75 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  27.89 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  29.49 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  33.15 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  31.91 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  26.52 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  30.05 
 
 		 601 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  29.95 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  28.85 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  28.04 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  28.4 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  34.39 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  27.51 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  28.04 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  32.76 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  27.27 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  28.04 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  26.79 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  27.07 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  28.42 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  27.5 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  27.89 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  30.53 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  26.52 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  30.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  30.34 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  25.53 
 
 		 319 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  27.84 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  24.06 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  27.32 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  24.06 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  32.22 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  27.15 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  26.52 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  24.32 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  30.25 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  27.42 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  25.62 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  31.98 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  29.14 
 
 		 166 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  31.82 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  28.79 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  32.4 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  34.94 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  24.23 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  27.27 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  23.86 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  22.16 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3139  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  39.36 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  24.37 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  27.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05567  GrpB domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01530)  35.9 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.68777 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  22.08 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  24.23 
 
 		 175 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  39.73 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  21.47 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>