17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2232 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1573    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  43.93 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  27.28 
 
 		 721 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  27.27 
 
 		 704 aa  258  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  27.66 
 
 		 702 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  29.17 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  28.5 
 
 		 744 aa  243  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.23 
 
 		 754 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  27.05 
 
 		 682 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  23.58 
 
 		 685 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  27.79 
 
 		 675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  25.45 
 
 		 718 aa  106  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  24.9 
 
 		 715 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  22.27 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  23.28 
 
 		 638 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  26.42 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0932  hypothetical protein  28.04 
 
 		 631 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  decreased coverage  0.000145164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>