20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2141 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  54.29 
 
 		 704 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1503    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  60.85 
 
 		 705 aa  843    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  50.07 
 
 		 702 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  37.25 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  28.24 
 
 		 773 aa  240  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  28.74 
 
 		 770 aa  240  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.9 
 
 		 754 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  24.15 
 
 		 718 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  23.5 
 
 		 685 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  21.09 
 
 		 557 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  23.93 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  22.85 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  24.8 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  24.01 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  29.6 
 
 		 974 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  23.95 
 
 		 437 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  23.04 
 
 		 383 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  21.78 
 
 		 535 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  22.37 
 
 		 535 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>