More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4056 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 		 112 aa  215  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  91.07 
 
 		 112 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 		 112 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 		 112 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  64.29 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0076  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0461291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  65.18 
 
 		 114 aa  153  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>