41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2799 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  313  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  53.17 
 
 
151 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  46.21 
 
 
163 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  39.39 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  38.57 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  41.94 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  45.79 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  35.71 
 
 
161 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  36.84 
 
 
148 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  36.23 
 
 
147 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  33.33 
 
 
150 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  30.92 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  36.18 
 
 
190 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  36.84 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  29.37 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  31.51 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  39.83 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  35.53 
 
 
181 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  32.86 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  36.61 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  39.74 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  33.33 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  35.4 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  30.08 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  31.88 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  37.04 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  36.15 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  30.4 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  38.78 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  34.19 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  33.05 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  33.76 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  33.62 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  38.79 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  35.43 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  36.45 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  25.36 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>