33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1821 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  48.89 
 
 
181 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  46.11 
 
 
181 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  45 
 
 
190 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  42.62 
 
 
199 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  43.82 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  42.7 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  39.56 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  41.38 
 
 
174 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  41.67 
 
 
234 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  39.18 
 
 
172 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  32.93 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  31.74 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  35.85 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  43.66 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  26.25 
 
 
79 aa  48.5  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 
107 aa  44.3  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  32.35 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  30.88 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
429 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  30.88 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  30.88 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  29.41 
 
 
254 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  27.94 
 
 
254 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  27.94 
 
 
254 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>