18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2670 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2670  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
457 aa  886    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1914  major facilitator superfamily MFS_1  71.79 
 
 
458 aa  627  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.42815  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3781  major facilitator superfamily MFS_1  60.6 
 
 
449 aa  558  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  65.53 
 
 
462 aa  558  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1884  major facilitator superfamily MFS_1  60.17 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  26.86 
 
 
401 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
394 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2949  major facilitator transporter  28.1 
 
 
401 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163593  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
402 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  21.33 
 
 
376 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  31.96 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  20.24 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.89 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 
436 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  19.66 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  29.46 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  25.58 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  34.29 
 
 
400 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>