41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2330 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 
64 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  60.71 
 
 
62 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  55.17 
 
 
62 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  53.33 
 
 
298 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  56.67 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  56.9 
 
 
61 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  55 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  54.55 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  54.39 
 
 
61 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  59.57 
 
 
557 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  46.43 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  48.98 
 
 
509 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  50.88 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  49.12 
 
 
523 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  53.06 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  53.85 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  48.21 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  56.6 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  49.06 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  46.67 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 
62 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  42.86 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1927  hypothetical protein  41.54 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062835  decreased coverage  0.000000000000486624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  48.89 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  41.82 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0963  hypothetical protein  37.04 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0640567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  40.74 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  48.98 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  44.9 
 
 
956 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  53.33 
 
 
226 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  52.08 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  35.71 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  30.36 
 
 
1001 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  37.5 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  38.6 
 
 
58 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>