27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1927 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062835  decreased coverage  0.000000000000486624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1378  hypothetical protein  52.38 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  43.75 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  44.26 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  44.26 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  44.26 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  44.26 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  41.94 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  61.36 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  41.27 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0066  hypothetical protein  57.78 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  33.87 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  41.54 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  39.34 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  40.98 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  39.68 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  37.7 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  39.22 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  38.89 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  43.1 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  48.94 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2059  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  36.92 
 
 		 298 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  40.74 
 
 		 557 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>