18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1668 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1668  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0667  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  64.46 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.286513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1686  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  63.16 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3614  hypothetical protein  63.01 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2506  DNA topoisomerase I  50.82 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  31.9 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  29.28 
 
 		 837 aa  55.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.64 
 
 		 837 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 812 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 		 853 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 814 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  30.15 
 
 		 834 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.41 
 
 		 849 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 814 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.58 
 
 		 817 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0508  hypothetical protein  39.47 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0168  hypothetical protein  47.83 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.916253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  24.05 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>