42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2277 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
259 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  42.17 
 
 
254 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  31.86 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  32.06 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.22 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.94 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  35.51 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  33.54 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.2 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.2 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.14 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  33.02 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.33 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  28.35 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  24.77 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  26.27 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  27.01 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  26.25 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  29.55 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.7 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 
346 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  25.97 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.38 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  31.82 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.81 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  28.23 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.59 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.59 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.28 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  24.24 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  35.48 
 
 
360 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.25 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  28.23 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
350 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.91 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>