132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14330 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.96 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.15 
 
 
368 aa  95.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.51 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  28.06 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.54 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  30.05 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.91 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.87 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.09 
 
 
580 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.4 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  29.83 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.96 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  31.43 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  31.16 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  26.52 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.6 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  28.25 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.71 
 
 
344 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.11 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2697  FMN-binding domain-containing protein  39.78 
 
 
304 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  0.011631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.87 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.73 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  26.37 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  26.18 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  25.65 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.73 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.9 
 
 
224 aa  57.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.08 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.46 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.21 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.03 
 
 
222 aa  54.7  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  29.29 
 
 
218 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  26.92 
 
 
215 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  27.51 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.63 
 
 
220 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  27.07 
 
 
212 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  26.2 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0454  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.43 
 
 
253 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.62 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.5 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  26.92 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  30.41 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  32.17 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0583  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.34 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.27 
 
 
233 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  26.92 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1571  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  31.31 
 
 
256 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.470446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.87 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  31.58 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  29.1 
 
 
209 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  26.92 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
206 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  24.04 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.37 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.63 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.95 
 
 
219 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  25.14 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.95 
 
 
219 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  24.49 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  24.37 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  32.74 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  28.67 
 
 
210 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.6 
 
 
200 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  27.34 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  32.46 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  26.67 
 
 
373 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  27.07 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  29.85 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1959  hypothetical protein  34.07 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.8 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  30.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  29.85 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  29.85 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  29.1 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.28 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.61 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  31.31 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.71 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.53 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  24.43 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  28.97 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.63 
 
 
625 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.67 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.66 
 
 
310 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  31.62 
 
 
208 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  31.62 
 
 
208 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.66 
 
 
310 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  25.14 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  25.14 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0942  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25 
 
 
262 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0138824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.6 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>