73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1959 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.84 
 
 		 344 aa  94.7  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.69 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  30.71 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  27.82 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.11 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  33.91 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  33.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.77 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  29.37 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0583  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.36 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.37 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.14 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  31.31 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.68 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.8 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.98 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  25.74 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  26 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.68 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  28.42 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.54 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.71 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.43 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.25 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.01 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.82 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  29.66 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  29.06 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  29.06 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  29.06 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.07 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  32.04 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.61 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  28.97 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  30.63 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  29.06 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  29.31 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  26.83 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  30.93 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  29.47 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.59 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.72 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  29.31 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  32.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  32.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  32.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  32.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  25.6 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  31.87 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  31.68 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  30.61 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3035  hypothetical protein  31.25 
 
 		 687 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  28.45 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  28.45 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  29.73 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.17 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.08 
 
 		 217 aa  42  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 222 aa  42  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  27.68 
 
 		 396 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.68 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  30.21 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  31.68 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  31.68 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>