15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04000  FMN-binding domain protein  100 
 
 
127 aa  252  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000143856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  32.76 
 
 
725 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  31.52 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  33.33 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.31 
 
 
368 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  26.36 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.96 
 
 
580 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.27 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  30.12 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  35.29 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.42 
 
 
609 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.89 
 
 
598 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  36.67 
 
 
715 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.82 
 
 
591 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  31.25 
 
 
657 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>