65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0020 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0017  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-2  tRNA-Cys  95.65 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  90.77 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  90.77 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  90.77 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  90.77 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  91.11 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  96.97 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0104  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0769  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.417673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0816  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000321659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0003  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>