48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2329 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0038  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000114556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0041  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73706  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNACysVIMSS1309369  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0023  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0036  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0602009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0013  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNACysVIMSS1309177  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNACysVIMSS1309280  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNACysVIMSS1309216  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNACysVIMSS1309136  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNACysVIMSS1309104  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.200833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0016  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139596  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0013  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0013  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>