35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE_tRNA-Cys-1 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0017  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0769  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.417673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt026  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00197554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>