36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1652 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0038  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000114556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0041  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000014718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0003  tRNA-Cys  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0023  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNACysVIMSS1309369  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0036  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0602009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0013  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0041  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNACysVIMSS1309177  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNACysVIMSS1309280  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNACysVIMSS1309216  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNACysVIMSS1309136  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNACysVIMSS1309104  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.200833  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>