72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_R0036 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNACysVIMSS1309369  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNACysVIMSS1309104  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.200833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNACysVIMSS1309136  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNACysVIMSS1309216  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNACysVIMSS1309280  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0041  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73706  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0013  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0602009  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNACysVIMSS1309177  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0023  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0038  tRNA-Cys  98.59 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000114556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0041  tRNA-Cys  95.83 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000014718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  93.06 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0084  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0026  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0049  tRNA-Cys  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.414451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0042  tRNA-Cys  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  87.3 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0061  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  87.3 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  87.3 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  87.3 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0048  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.151356  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>