49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Cys-1 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0104  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263285  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-2  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0471  tRNA-Cys  91.84 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0029  tRNA-Cys  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.980358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt026  tRNA-Cys  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>