13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0029 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0029  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.980358 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0104  tRNA-Cys  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>