13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6089 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  35.48 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  35.22 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  33.96 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  34.19 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  35.06 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  31.33 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  36.9 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  36.9 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  31.75 
 
 
189 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  28.72 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>