164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4653 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  60.93 
 
 		 499 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  100 
 
 		 499 aa  1045    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  60.45 
 
 		 499 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  60.85 
 
 		 499 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  62.27 
 
 		 495 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  60.69 
 
 		 507 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  58.95 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  54.89 
 
 		 513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  44.9 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  62.41 
 
 		 775 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  61.01 
 
 		 898 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  38.36 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  39.26 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  37.63 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  36.79 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  37.42 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  37.13 
 
 		 472 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  37.45 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  37.65 
 
 		 475 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  37.37 
 
 		 470 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  37.76 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  37.76 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  37 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  37.13 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  37.13 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  37.13 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  37.13 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  36.34 
 
 		 459 aa  309  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  35.88 
 
 		 416 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  32.43 
 
 		 423 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  32.84 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  32.18 
 
 		 478 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  31.48 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  40.29 
 
 		 675 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  31.13 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  38.44 
 
 		 680 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  38.79 
 
 		 679 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  39 
 
 		 672 aa  217  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  31.48 
 
 		 449 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  31.48 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  38.51 
 
 		 692 aa  199  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  40.6 
 
 		 269 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  40.98 
 
 		 269 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  30.42 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  29.63 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  29.63 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  29.63 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  29.67 
 
 		 510 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  29.63 
 
 		 510 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  29.18 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  29.2 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  29.55 
 
 		 511 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  29.55 
 
 		 511 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  28.2 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  29.18 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  28.89 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  29.23 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  27.77 
 
 		 532 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  29.22 
 
 		 517 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  29.22 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  28.46 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  29.23 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  28.16 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  27.41 
 
 		 515 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  28.34 
 
 		 507 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  28.34 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  29.48 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  30.51 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  29.23 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  34.85 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  27.6 
 
 		 520 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  30.2 
 
 		 509 aa  173  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  28.83 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  29.08 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  34.08 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  29.45 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  34.36 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  28.74 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  29.36 
 
 		 508 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  34.36 
 
 		 508 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  27.22 
 
 		 559 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  33.95 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  28.51 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  27.66 
 
 		 502 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  29.92 
 
 		 508 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  27.66 
 
 		 502 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  27.55 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  27.56 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  33.73 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  29.71 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  27.02 
 
 		 559 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  29.07 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>