27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4464 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  56.18 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  50.56 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  53.93 
 
 		 99 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  47.19 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  48.31 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  48.31 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  48.31 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  39.33 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  39.06 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  38.75 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  29.55 
 
 		 91 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  33.85 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  34.72 
 
 		 90 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>