9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4012 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4012  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 910 aa  1808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.67 
 
 		 1557 aa  56.2  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  39.25 
 
 		 404 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.51 
 
 		 2807 aa  49.3  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  25.16 
 
 		 829 aa  48.5  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1289 aa  48.1  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.43 
 
 		 974 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  33.82 
 
 		 1838 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.55 
 
 		 1126 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>