73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2945 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2945  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  48.78 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  43.18 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0458  acyl carrier protein  41.86 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.89611  normal  0.887307 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  35.9 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1523  phosphopantetheine-binding  37.74 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  39.53 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  39.53 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  39.53 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  36.36 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.93 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  41.86 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  41.86 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  43.18 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  42.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  35.9 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  43.18 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  42.5 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  37.7 
 
 
78 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  41.18 
 
 
91 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  42.55 
 
 
82 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  37.7 
 
 
78 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2402  phosphopantetheine-binding  36 
 
 
78 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  43.9 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  42.55 
 
 
82 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  28.77 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  28.77 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  42.5 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  45.24 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  28.77 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  45.24 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  41.46 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  43.9 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  43.9 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  36.17 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  40.48 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  40 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  39.53 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  35.38 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  39.53 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  40 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  39.53 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0219  Acyl carrier protein  36.17 
 
 
91 aa  40  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  45.24 
 
 
77 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0750  phosphopantetheine-binding  36.62 
 
 
93 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0676066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>