22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1523 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1523  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
77 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2402  phosphopantetheine-binding  46.97 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2885  hypothetical protein  41.43 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.845962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3361  hypothetical protein  38.96 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1193  acyl carrier protein  34.25 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2945  phosphopantetheine-binding protein  37.74 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  31.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  35.14 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf292  acyl carrier protein, putative  37.25 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.051043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  30.67 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  27.85 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  34 
 
 
5778 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  34 
 
 
5993 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  34 
 
 
4212 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  34 
 
 
5822 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>