38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3593 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  673    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1065  glycosyl transferase group 1  94.58 
 
 		 369 aa  633  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.912454 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 		 705 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  22.95 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.86 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1234  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000428229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  24.56 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  25.23 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  30.41 
 
 		 412 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>