29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0039 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.08 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.13 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.29 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  32 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  30.67 
 
 		 191 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  31.51 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  31.51 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  31.51 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  32 
 
 		 191 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>