25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1074 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  59.95 
 
 		 862 aa  995    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  40.08 
 
 		 895 aa  642    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  100 
 
 		 843 aa  1683    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  39.25 
 
 		 701 aa  542  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  23.66 
 
 		 820 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  27.99 
 
 		 863 aa  213  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  28.46 
 
 		 867 aa  207  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  28.75 
 
 		 878 aa  204  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  28.64 
 
 		 868 aa  200  7e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  22.82 
 
 		 903 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  21.65 
 
 		 871 aa  125  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  20.59 
 
 		 919 aa  125  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  21.14 
 
 		 868 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  22.4 
 
 		 612 aa  88.6  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 536 aa  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.3 
 
 		 587 aa  48.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 507 aa  48.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 528 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 578 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.98 
 
 		 532 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.84 
 
 		 520 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 632 aa  46.2  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.54 
 
 		 531 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 607 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 532 aa  44.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>