22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3417 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  100 
 
 		 459 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  32.65 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  30.97 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  29.15 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  25.58 
 
 		 311 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.47 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  22.22 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  23.41 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  25.35 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  24.13 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  21.8 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  22.41 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  21.16 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  23.36 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  24.18 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  20.86 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  20.07 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  27.84 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  19.96 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  22.49 
 
 		 414 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  19.53 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0134  YbbR-like protein  25.31 
 
 		 327 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>