More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2074 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
349 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  63.36 
 
 
336 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  45.24 
 
 
364 aa  298  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  48.08 
 
 
362 aa  295  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  47.01 
 
 
369 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.86 
 
 
384 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.52 
 
 
349 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  35 
 
 
327 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 
341 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  32.44 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  32.25 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.44 
 
 
380 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.5 
 
 
362 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  35.14 
 
 
366 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  33.42 
 
 
379 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  32.86 
 
 
378 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
373 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  32.86 
 
 
378 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  33.42 
 
 
372 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  32.65 
 
 
353 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.61 
 
 
347 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  33.62 
 
 
349 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  34.67 
 
 
319 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.61 
 
 
343 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.05 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.38 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  37.07 
 
 
320 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 
332 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  34.73 
 
 
346 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 
360 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 
394 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 
328 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.92 
 
 
316 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  38.14 
 
 
346 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 
328 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.64 
 
 
316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  30 
 
 
357 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.31 
 
 
316 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.62 
 
 
319 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.33 
 
 
360 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 
329 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.42 
 
 
367 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.31 
 
 
319 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.31 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.25 
 
 
320 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.62 
 
 
316 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.31 
 
 
316 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.62 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  33.05 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  41.85 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  34.32 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.93 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  32.76 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  32.74 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 
375 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  32.59 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.93 
 
 
349 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  32.99 
 
 
402 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.88 
 
 
364 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.91 
 
 
402 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  32.74 
 
 
423 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  32.74 
 
 
423 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  32.38 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  33.42 
 
 
417 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  31.28 
 
 
355 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.87 
 
 
365 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.53 
 
 
326 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.63 
 
 
354 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  32.38 
 
 
395 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 
377 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  32.23 
 
 
338 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  39.78 
 
 
318 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  31.79 
 
 
406 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  31.86 
 
 
527 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  31.16 
 
 
353 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  32.06 
 
 
395 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 
403 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 
424 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 
388 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.36 
 
 
358 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
320 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  32.06 
 
 
395 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 
402 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.51 
 
 
374 aa  169  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.05 
 
 
361 aa  169  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 
328 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  31.93 
 
 
406 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  31.48 
 
 
355 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 
310 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.02 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  32.43 
 
 
410 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  43.72 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>