21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0894 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1008    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 790 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 790 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 790 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 790 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 790 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  27.87 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  27.87 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 935 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 934 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  25.99 
 
 		 859 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 867 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  26.58 
 
 		 862 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  32.45 
 
 		 859 aa  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 856 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 908 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 		 879 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.86 
 
 		 841 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 840 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>