More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0207 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  100 
 
 		 637 aa  1327    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 437 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 652 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  32.97 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  31.4 
 
 		 653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 687 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.29 
 
 		 662 aa  125  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  31.5 
 
 		 774 aa  124  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.77 
 
 		 634 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  32.59 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.1 
 
 		 666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  30.68 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  31.05 
 
 		 403 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 774 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 861 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  27.84 
 
 		 638 aa  120  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  31.2 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  32.84 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.9 
 
 		 551 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  31.11 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.19 
 
 		 623 aa  115  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 771 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.2 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  29.68 
 
 		 656 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.68 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.26 
 
 		 790 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 777 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.21 
 
 		 668 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 		 564 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.89 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.83 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 752 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.9 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 503 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.78 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.52 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 		 419 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.57 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.12 
 
 		 863 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.17 
 
 		 653 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 651 aa  105  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 493 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 414 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 		 880 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.06 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  30.43 
 
 		 692 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.96 
 
 		 1373 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 		 705 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.95 
 
 		 632 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2348  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.6 
 
 		 664 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.6 
 
 		 664 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 855 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  30.43 
 
 		 537 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1036  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 625 aa  101  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 612 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.88 
 
 		 867 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 624 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 624 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.71 
 
 		 627 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.42 
 
 		 621 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.05 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 457 aa  99.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 612 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 		 776 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.09 
 
 		 1183 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 624 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  27.32 
 
 		 625 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>